Afin de mieux coordonner les investissements, les orientations révisées permettent à la Commission de désigner des coordinateurs européens chargés de tronçons transfrontaliers individuels, de groupes de projets situés sur le même axe prioritaire, ou d’un axe entier. Ces coordinateurs européens, agissant au nom de la Commission, traiteront essentiellement des projets requérant un appui solide, souvent politique, dans le but de surmonter les difficultés des phases de planification et de construction. Ils favoriseront la coopération avec les usagers et les opérateurs, présenteront les projets aux investisseurs privés ainsi qu’aux établissements financiers, y compris au sein de l’UE, et informeront la Commission européenne des progrès accomplis.

Lors de la première phase, des coordinateurs européens ont été désignés le 20 juillet 2005 pour les axes prioritaires nos 1, 3, 6, 17 et 27, ainsi que pour la mise en oeuvre du système européen de gestion du trafic ferroviaire (ERTMS).