Näissä ohjeissa on suosituksia siitä, miten nämä säännökset olisi pantava täytäntöön rakennerahastojen, koheesiorahaston ja Euroopan kalatalousrahaston (jäljempänä ’rahastot’) osalta, jotta tuotettaisiin johdonmukaisia, vertailukelpoisia ja hyödyllisiä tietoja toimielinten välisen sopimuksen tavoitteiden mukaisesti ja erityisesti pyrittäisiin myönteiseen tarkastuslausumaan ja jotta otettaisiin huomioon Euroopan tilintarkastustuomioistuimen antama lausunto nro 6/2007. Euroopan kalatalousrahasto on mukana, koska se on jäsenvaltioiden kanssa yhteistyössä hallinnoitava rahasto ja on rakennetoimiin nähden ”vastaava toimi”.