Borkovice, Bošilec, Cep, České Velenice, Chlum u Třeboně, Domanín, Doňov, Drahotěšice, Drahov, Dunajovice, Dvory nad Lužnicí, Dynín, Frahelž, Halámky, Hamr, Hatín, Hrachoviště, Kardašova Řečice, Klec, Lásenice, Lomnice nad Lužnicí, Lužnice, Majdalena, Mazelov, Mažice, Neplachov, Nová Ves nad Lužnicí, Novosedly nad Nežárkou, Pístina, Plavsko, Pleše, Pluhův Žďár, Ponědraž, Ponědrážka, Příbraz, Rapšach, Řípec, Smržov, Staňkov, Stráž nad Nežárkou, Stříbřec, Suchdol nad Lužnicí, Sviny, Třeboň, Újezdec, Val, Veselí nad Lužnicí, Višňová, Vlkov, Záblatí, Záhoří, Zálší, Žíšov, Zlukov