La Commission coordonne les mesures de sécurité sanitaire dans l'UE par l'intermédiaire de son comité de sécurité sanitaire. Ce comité réunit des représentants de tous les pays de l'UE et porte sur trois grands domaines: la préparation générale, la grippe et les risques chimiques, biologiques, radiologiques et nucléaires.
Au niveau européen, le comité est le principal mécanisme de coordination des efforts en matière de sécurité sanitaire. C'est un organe informel de coopération et de coordination, axé sur les menaces sanitaires imputables à des actes terroristes ou à la dispersion délibérée d'agents biologiques ou autres. Il vise également à élever le niveau de préparation aux menaces transfrontalières, notamment en cas de grippe pandémique.

