Pour élargir et diversifier encore plus les sources de conseil, le BEPA a décidé, en accord avec le Président, de mettre en place des groupes d’experts de haut niveau dans les trois domaines politiques déjà cités. Ces groupes d’experts réunissent des fonctionnaires d’autres services de la Commission et des experts extérieurs sélectionnés dans des universités ou des centres d’études ou encore du monde des affaires. Chacun de ces trois groupes dispose d’un comité de pilotage qui planifie le travail, prépare les réunions et en assure le suivi. Les réunions des groupes sont présidées par le Président de la Commission, et les Commissaires concernés y participent ainsi que les membres du comité de pilotage, les membres extérieurs sélectionnés par le Président parmi les personnes prestigieuses de l’Université et de la société civile en général.
Ces groupes sont les suivants:
Groupe d'Analyse Politique (GPA)
Groupe d'Analyse de Politique Économique (GEPA)
Groupe d'Analyse de Politique Sociétale (GSPA)