Un concetto importante nella zootecnia biologica è la creazione di un ambiente che si adatti alle specie animali che ci vivono. All'interno di questo concetto ci sono alcune pratiche comuni, tra le quali:

• Accesso permanente all'aria aperta
• Cibo appropriato ai bisogni nutrizionali e comportamentali
• Divieto della catena o dell' isolamento
• Giacigli e stalle adeguate
• Basso carico di bestiame
• Limitare i tempi di trasporto

Un principio biologico generale proibisce pavimenti grigliati per le aree di riposo

L'allevamento biologico vieta la rimozione o la riduzione di:

• Code - da pecore, maiali, etc.
• Becchi - da galline, tacchini, etc.
• Corna - da bovini, pecore etc.

è anche comune nelle pratiche di gestione dell’allevamento che esse vengano adattate alle diverse specie. Per esempio, al pollame può essere concesso un lungo periodo di inattività tra una consegna di uova. Esse possono anche essere tenute in piccoli gruppi per stabilire gerarchie sociali che avverrebbero in natura.

La nuova regolamentazione europea sull'agricoltura biologica fa direttamente riferimento alle pratiche di zootecnia in diversi punti, incluso questo: il personale che si occupa degli animali dovrebbe avere le conoscenze di base e l'esperienza necessaria per la salute e i fabbisogni di benessere animale.

L'agricoltura biologica sottolinea che il dolore e la sofferenza devono essere ridotti al minimo durante tutta la vita dell'animale. Quindi, i tempi di trasporto sono strettamente controllati e il metodo di macellazione è studiato per essere il più veloce e indolore possibile.