O primeiro passo para a obtenção duma saúde animal satisfatória reside na escolha de raças de acordo com a sua vitalidade, adaptabilidade às condições locais e resistência às doenças. A preferência por raças e variedades autóctones adequadas ao ambiente da exploração agrícola ajuda neste sentido.

A agricultura biológica também funciona no sentido de encorajar as defesas imunológicas naturais dos animais ao providenciar-lhes o seguinte:

• Alimentos adequados e de elevada qualidade
• Exercício regular
• Acesso livre a pastagens adequadas

Outros métodos de prevenção de doenças incluem:

• Manutenção das condições higiénicas de abrigos adequados e apropriados
• Quantidade de gado por área adequada, quer no exterior, quer quando os animais necessitam de estar no interior, como acontece nos meses de Inverno.

É claro que toda a prevenção do mundo não consegue impedir que os animais sofram doenças ou feridas ocasionais e nesses casos os agricultores biológicos precisam de actuar depressa para garantirem que o sofrimento ou a dor são reduzidas ao mínimo e que os animais afectados recuperam o máximo da sua saúde o mais depressa possível.

Tratamentos preferidos pela agricultura biológica incluem:

• Homeopatia – um tratamento alternativo usando doses altamente diluídas de agentes causadores de sintomas semelhantes aos da doença – agentes causais - encorajando o corpo a fortalecer-se ele próprio contra a doença.
• Fitoterapia – tratamentos „“herbais“ usando plantas e seus extractos

Dado que a saúde e bem-estar dos animais é fundamental, os tratamentos veterinários habituais podem ser utilizados para redução do sofrimento dos animais sempre que a homeopatia e a fitoterapia não sejam apropriadas.

O novo Regulamento da UE para a agricultura biológica contém, por exemplo, os seguintes pontos:

A doença deve ser tratada imediatamente para evitar o sofrimento do animal. Medicamentos veterinários alopáticos sintéticos, incluindo antibióticos, poderão ser utilizados sob condições restritas, quando o uso de fitoterápicos, homeopáticos e outros produtos não for apropriado. Restrições relativas à evolução do tratamento e aos intervalos de segurança dos medicamentos devem ser muito bem definidos.